全基因组测序

样本类型

样本要求

保存及运输条件

说明内容

新鲜组织

1.新鲜组织标本（肿瘤样本在术后 30分钟内取得）≥50mg（黄豆粒大小），-80℃直接长期冻存，-20℃可保存2-3个月。

2.穿刺样本：肿瘤组织长度≥1 cm，2-3条；所有新鲜组织标本要求未坏死肿瘤组织比例在70%以上；必须首先进行常规病理诊断，可于-80℃直接长期冻存，-20℃可保存2-3个月 。

干冰运输

白片/蜡卷

1.切片厚度3-5 μm，5-10张（组织≥1×1 cm² ）或10-20张（组织＜1×1 cm²）切片；白片置于切片盒中。

2.蜡卷：直接置于1.5 mL无菌离心管中。

常温保存和运输

蜡卷应保证组织含量充足；尽量送检一年以内的石蜡标本。

外周血（DNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL静脉血，4℃保存，4-6小时内分离血浆，分离后血浆不少于2 mL。

2.Streck管采集样本：4-5 mL静脉血，常温可存储72 h，分离后血浆不少于2 mL。

1.EDTA 抗凝管采集的血液，经分离血浆后，48 h内送达，可使用足量冰袋，用泡沫箱运输；超过48 h，使用干冰运输。2.Streck管采集的血液，72 h内送达，常温运输，注意避免剧烈震荡。

收样后立刻提取或-80℃暂存。

外周血（cfDNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL静脉血；4℃保存，4-6小时内分离血浆，分离后血浆不少于原体积一半；分离后的血浆在-20℃冰箱最多可保存一周。

2.Streck管：4-5 mL静脉血，分离后血浆不少于原体积一半，常温可存储72 h。

1.EDTA抗凝管采集的血液，经分离血浆后，48 h内送达，可使用足量冰袋，用泡沫箱运输；超过48 h，使用干冰运输。2.Streck管采集的血液，72 h内送达，常温运输，注意避免剧烈震荡。

收样后立刻提取。

gDNA

基因组DNA用TE溶解；总量≥500 ng （采用HiSeq X平台）或≥2 μg （采用HiSeq2000/2500平台）；纯度OD_260/280在1.8-2.0之间；浓度≥50 ng/μL。DNA完整无降解，无 RNA、蛋白质等污染。

使用 1.5 mL或2 mL离心管盛放，用parafilm封口膜密封，然后将样本管置于保护用的50 mL离心管或其他类似容器里，并旋紧盖子。使用足量冰袋，用泡沫箱运输。

某些种类植物DNA 样本需要专门去除多糖。