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全基因组测序
全基因组测序(WGS)是全面分析基因组的方法。可全面扫描基因组上的变异信息,一次性挖掘大量的生物标记物,已被广泛应用于疾病、癌症的基因组研究。
技术优势
·准确性高、可重复性好、定位切确
·快速、有效地读取高质量测序数据,高水平专业的生信分析
·可以广泛应用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化、育种品种的研究并提供科学依据
服务流程
样本要求
样本类型 |
样本要求 |
保存及运输条件 |
说明内容 |
新鲜组织 |
1.新鲜组织标本(肿瘤样本在术后 30分钟内取得)≥50mg(黄豆粒大小),-80℃直接长期冻存,-20℃可保存2-3个月。 2.穿刺样本:肿瘤组织长度≥1 cm,2-3条;所有新鲜组织标本要求未坏死肿瘤组织比例在70%以上;必须首先进行常规病理诊断,可于-80℃直接长期冻存,-20℃可保存2-3个月 。 |
干冰运输 |
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白片/蜡卷 |
1.切片厚度3-5 μm,5-10张(组织≥1×1 cm2 )或10-20张(组织<1×1 cm2)切片;白片置于切片盒中。 2.蜡卷:直接置于1.5 mL无菌离心管中。 |
常温保存和运输
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蜡卷应保证组织含量充足;尽量送检一年以内的石蜡标本。 |
外周血(DNA) |
1.EDTA抗凝管采集(紫色):4-5 mL静脉血,4℃保存,4-6小时内分离血浆,分离后血浆不少于2 mL。 2.Streck管采集样本:4-5 mL静脉血,常温可存储72 h,分离后血浆不少于2 mL。 |
1.EDTA 抗凝管采集的血液,经分离血浆后,48 h内送达,可使用足量冰袋,用泡沫箱运输;超过48 h,使用干冰运输。2.Streck管采集的血液,72 h内送达,常温运输,注意避免剧烈震荡。 |
收样后立刻提取或-80℃暂存。 |
外周血(cfDNA) |
1.EDTA抗凝管采集(紫色):4-5 mL静脉血;4℃保存,4-6小时内分离血浆,分离后血浆不少于原体积一半;分离后的血浆在-20℃冰箱最多可保存一周。 2.Streck管:4-5 mL静脉血,分离后血浆不少于原体积一半,常温可存储72 h。 |
1.EDTA抗凝管采集的血液,经分离血浆后,48 h内送达,可使用足量冰袋,用泡沫箱运输;超过48 h,使用干冰运输。2.Streck管采集的血液,72 h内送达,常温运输,注意避免剧烈震荡。 |
收样后立刻提取。 |
gDNA |
基因组DNA用TE溶解;总量≥500 ng (采用HiSeq X平台)或≥2 μg (采用HiSeq2000/2500平台);纯度OD260/280在1.8-2.0之间;浓度≥50 ng/μL。DNA完整无降解,无 RNA、蛋白质等污染。 |
使用 1.5 mL或2 mL离心管盛放,用parafilm封口膜密封,然后将样本管置于保护用的50 mL离心管或其他类似容器里,并旋紧盖子。使用足量冰袋,用泡沫箱运输。 |
某些种类植物DNA 样本需要专门去除多糖。 |
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